Kas ir šūnās iekļūstošie peptīdi?

Peptīdi, kas iekļūst šūnās, ir mazi peptīdi, kas var viegli iekļūt šūnu membrānā.Šī molekulu klase, jo īpaši CPP ar mērķa funkcijām, sola efektīvu zāļu piegādi mērķa šūnām.

Tāpēc pētījumiem par to ir noteikta biomedicīnas nozīme.Šajā pētījumā tika pētīti CPP ar atšķirīgu transmembrānu aktivitāti secības līmenī, mēģinot noskaidrot CPP transmembrānu aktivitāti ietekmējošos faktorus, secību atšķirības starp CPP ar dažādām aktivitātēm un NonCPP, kā arī ieviest bioloģisko secību analīzes metodi.

CPP un NonCPP sekvences tika iegūtas no CPPsite datu bāzes un dažādām literatūrām, un no CPP sekvencēm tika iegūti transmembrānu peptīdi (HCPP, MCPP, LCPP) ar augstu, vidēju un zemu transmembrānu aktivitāti, lai izveidotu datu kopas.Pamatojoties uz šīm datu kopām, tika veikti šādi pētījumi:

1, Dažādu aktīvo CPP un NonCPP aminoskābju un sekundāro struktūru sastāvs tika analizēts ar ANOVA.Tika konstatēts, ka aminoskābju elektrostatiskā un hidrofobā mijiedarbība spēlēja nozīmīgu lomu CPP transmembrānas aktivitātē, un spirālveida struktūra un nejauša spirāle ietekmēja arī CPP transmembrānu aktivitāti.

2. Divdimensiju plaknē tika parādītas dažādu aktivitāšu CPP fizikālās un ķīmiskās īpašības un garumi.Tika konstatēts, ka CPP un NonCPP ar dažādām aktivitātēm var tikt grupēti zem dažām īpašām īpašībām, un HCPP, MCPP, LCPP un NonCPP tika sadalīti trīs klasteros, parādot to atšķirības;

3. Šajā rakstā ir ieviests bioloģiskās secības fizikālā un ķīmiskā centroīda jēdziens, un atlikumi, kas veido secību, tiek uzskatīti par daļiņu punktiem, un secība ir abstrahēta kā daļiņu sistēma izpētei.Šī metode tika izmantota CPP analīzē, projicējot CPP ar dažādām aktivitātēm 3D plaknē ar PCA metodi, un tika konstatēts, ka lielākā daļa CPP grupējās kopā un daži LCPP grupējās kopā ar NonCPP.

Šis pētījums ietekmē CPP izstrādi un izpratni par CPP secību atšķirībām ar dažādām darbībām.Turklāt šajā rakstā aprakstītā bioloģisko secību fizikālā un ķīmiskā centroīda analīzes metode var tikt izmantota arī citu bioloģisku problēmu analīzei.Tajā pašā laikā tos var izmantot kā ievades parametrus dažām bioloģiskās klasifikācijas problēmām, un tiem ir nozīme modeļa atpazīšanā.