Četras pretmikrobu peptīdu īpašības

Šie pretmikrobu peptīdi sākotnēji tika iegūti no kukaiņu, zīdītāju, abinieku uc aizsardzības sistēmām, un tie galvenokārt ietver četras kategorijas:

1. Cecropin sākotnēji atradās Cecropiamoth imūnajā limfā, kas galvenokārt atrodas citos kukaiņos, un līdzīgi baktericīdi peptīdi ir atrodami arī cūku zarnās.Tiem parasti ir raksturīgs stipri sārmains N-gala reģions, kam seko garš hidrofobs fragments.

2. Xenopus pretmikrobu peptīdi (magainīns) ir iegūti no varžu muskuļiem un kuņģa.Tika konstatēts, ka ksenopusa pretmikrobu peptīdu struktūra ir spirālveida, īpaši hidrofobā vidē.Ksenopusa antipeptīdu konfigurācija lipīdu slāņos tika pētīta ar N-marķētu cietās fāzes KMR.Pamatojoties uz acilamīna rezonanses ķīmisko nobīdi, ksenopusa antipeptīdu spirāles bija paralēlas divslāņu virsmas, un tās varēja saplūst, veidojot 13 mm būru ar periodisku spirālveida struktūru 30 mm.

3. defensīna aizsardzības peptīdi ir iegūti no cilvēka polikariotu neitrofilu trušu polimakrofāgiem ar pilnām kodollobulēm un dzīvnieku zarnu šūnām.No kukaiņiem tika ekstrahēta pretmikrobu peptīdu grupa, kas līdzīga zīdītāju aizsardzības peptīdiem, ko sauc par "kukaiņu aizsardzības peptīdiem".Atšķirībā no zīdītāju aizsardzības peptīdiem, kukaiņu aizsardzības peptīdi ir aktīvi tikai pret grampozitīvām baktērijām.Pat kukaiņu aizsardzības peptīdi satur sešus Cys atlikumus, bet disulfīda saistīšanas metode viena ar otru ir atšķirīga.No Drosophila melanogast ekstrahēto antibakteriālo peptīdu intramolekulārais disulfīda tilta saistīšanās veids bija līdzīgs augu aizsardzības peptīdu savienojuma veidam.Kristāla apstākļos aizsardzības peptīdi tiek parādīti kā dimēri.

4.Tachiplezīnu iegūst no pakavkrabjiem, ko sauc par pakaviem.Konfigurācijas pētījumi liecina, ka tas izmanto pretparalēlu B-locīšanas konfigurāciju (3-8 pozīcijas, 11-16 pozīcijas), kurāβ-leņķis ir savienots viens ar otru (8-11 pozīcijas), un starp 7. un 12. pozīcijām un starp 3. un 16. pozīcijām veidojas divas disulfīda saites.Šajā struktūrā hidrofobā aminoskābe atrodas vienā plaknes pusē, un seši katjonu atlikumi parādās uz molekulas astes, tāpēc struktūra ir arī biofīla.

No tā izriet, ka gandrīz visi pretmikrobu peptīdi pēc būtības ir katjoni, lai gan tie atšķiras pēc garuma un augstuma;Augstākajā galā, vai nu alfa-spirāles formā, vaiβ-Saliekama, bitropiska struktūra ir kopīga iezīme.