Šajā rakstā ir ieviestas divas pamata aminoskābes, glicīns (Gly) un alanīns (Ala).Tas ir galvenokārt tāpēc, ka tie var darboties kā bāzes aminoskābes, un, pievienojot tām grupas, var rasties cita veida aminoskābes.
Glicīnam ir īpaša salda garša, tāpēc tā nosaukums angļu valodā cēlies no grieķu vārda glykys (sweet).Glicīna tulkojumā ķīniešu valodā ir ne tikai “salda” nozīme, bet arī līdzīga izruna, ko var saukt par “uzticības, sasniegumu un elegances” modeli.Saldās garšas dēļ glicīnu bieži izmanto kā aromatizētāju pārtikas rūpniecībā, lai noņemtu rūgtumu un palielinātu saldumu.Glicīna sānu ķēde ir maza, tajā ir tikai viens ūdeņraža atoms.Tas viņu padara atšķirīgu.Tā ir pamata aminoskābe bez hiralitātes.
Glicīnam olbaltumvielās ir raksturīgs mazs izmērs un elastība.Piemēram, kolagēna trīspavedienu spirāles konformācija ir ļoti īpaša.Uz katriem diviem atlikumiem ir jābūt vienam glicīnam, pretējā gadījumā tas radīs pārāk daudz sterisku traucējumu.Tāpat saiknei starp diviem proteīna domēniem bieži ir nepieciešams glicīns, lai nodrošinātu konformācijas elastību.Tomēr, ja glicīns ir pietiekami elastīgs, tā stabilitāte noteikti ir nepietiekama.
Glicīns ir viens no spoileriem α-spirāles veidošanās laikā.Iemesls ir tāds, ka sānu ķēdes ir pārāk mazas, lai vispār stabilizētu konformāciju.Turklāt buferšķīdumu pagatavošanai bieži izmanto glicīnu.Tie no jums, kas veic elektroforēzi, bieži to atceras.
Alanīna nosaukums angļu valodā cēlies no vācu valodas acetaldehīds, un ķīniešu nosaukums ir vieglāk saprotams, jo alanīns satur trīs oglekli un tā ķīmiskais nosaukums ir alanīns.Tas ir vienkāršs nosaukums, tāpat kā aminoskābes raksturs.Alanīna sānu ķēdē ir tikai viena metilgrupa, un tā ir nedaudz lielāka nekā glicīna ķēde.Kad es uzzīmēju strukturālās formulas pārējām 18 aminoskābēm, es pievienoju alanīnam grupas.Olbaltumvielās alanīns ir kā ķieģelis, izplatīts būvmateriāls, kas ne ar vienu nekonfliktē.
Alanīna sānu ķēdei ir maz šķēršļu, un tā atrodas α-spirālē, kas ir konformācija.Tas ir arī ļoti stabils, kad tas ir salocīts β.Olbaltumvielu inženierijā, ja vēlaties mutēt aminoskābi bez īpaša mērķa proteīnam, parasti varat to mutēt uz alanīnu, kas nav viegli iznīcināt proteīna vispārējo konformāciju.
Izsūtīšanas laiks: 2023. gada 29. maijs